Den historiska perioden av Egypten började vid skiftet av det tredje och fjärde årtusendet före Kristi födelse. Den antika kulturtraditionen, som genomgick inflytande av inkräktare och interna omvälvningar, varade fram till antagandet av kristendomen på det fjärde århundradet e. Kr. I nästan tre och ett halvt tusen år har de egyptiska gudarnas lista och funktioner genomgått betydande förändringar. Egyptiska gudar fick egenskaper och namn som var karakteristiska för sina grannar - assyrier, hetiter, hyksos, hellener.
Efter enandet av Egypten under en enda härskares styre gick många gudar från enskilda regioner och stammar i landet in i det gemensamma pantheonet, men de flesta av dem vördades endast i miljön där deras kult uppstod. Vissa gudar fick gradvis en gemensam egyptisk betydelse. Gudinnan Bastet, som har ett katthuvud, växte utan tvekan ur en kult av vördnad av katter som väktare av spannmålsreserver från möss. Jordbruket spelade en stor roll i Egyptenroll, till skillnad från till exempel Hellas, som steg främst på grund av handel och militära erövringar. Antropomorfa egyptiska gudar var ofta utrustade med huvudet av ett djur, på grundval av den vördnad som den eller den kulten uppstod för. Till exempel hade guden Thoth huvudet av en ibis, gudinnan Sokhmet (Sekhmet) hade huvudet av ett lejon, Anubis hade huvudet av en hund.
När vissa delar av landet höjde sig, skedde en förändring av dynastier eller "flyttning" av huvudstaden till en ny plats, de egyptiska gudarna i "första skiktet" förändrades också. Ett intressant inslag i den antika egyptiska religionen var närvaron av ett stort antal kosmogoniska myter (det vill säga versioner av världens ursprung), och på varje ort spelade den lokala gudomen huvudrollen i denna svåra fråga.
Egyptiska gudar i så stort antal, som blev grunden för lokal separatism, behövdes utan tvekan inte av ett enda land. Dessutom krävde åtskilliga kulter utgifterna för en stor mängd materiella resurser, som med mycket större nytta kunde spenderas på landets inre arrangemang, på arméns underhåll osv. Och med stor rikedom och inflytande hotade de prästerliga klanerna direkt faraos enda makt.
Farao Amenhotep IV, som tar namnet Akhenaton, introducerar kulten av en mindre regional gudom Aton (den gudomliga solskivan) som en vanlig egyptisk religion. Men traditionens tröghet var för stark, och Akhenaton dör innan han fyllt fyrtio år. Enligt den mest övertygande versionen var han detförgiftad. Det är sant att förföljelsen inte berörde familjen, och hans fru (den berömda Nefertiti) förblev vid liv många år efter hennes mans död.
Efter det persiska och senare det grekiska övertagandet av landet börjar de egyptiska gudarna och gudinnorna gradvis att förlora sitt tidigare inflytande, faller i förfall. De smälter samman med inkräktarnas gudar. Till exempel var Alexander den store vördad i Egypten som son till Zeus-Amon, en synkretisk egyptisk-hellenistisk gudom.
När de egyptiska gudarna, vars namn hade både lok alt och blandat ursprung, började ge vika för en ny religion – kristendomen, började glömskan av den antika egyptiska skriften gradvis. Under kejsar Konstantins regeringstid dog den sista bäraren av den egyptiska religiösa traditionen, varefter under många århundraden var namnen på de antika egyptiska gudarna kända endast från grekiska och romerska historikers skrifter. Men båda bekantade sig med den egyptiska kulturen vid en tidpunkt då den redan höll på att avta, och det är osannolikt att prästerna initierade främlingar (ofta aggressiva sådana) till hemligheterna i sin religion.
Försök att dechiffrera de gamla hieroglyferna gjordes upprepade gånger av både arabiska vetenskapsmän och européer, men utan resultat. Och först i början av artonhundratalet lyckades den briljante lingvisten Francois Champollion hitta nyckeln till att dechiffrera de egyptiska texterna. Från det ögonblicket började den moderna eran av att studera historien och kulturen i det antika Egypten.